Boudry est situé au pied du Jura, dans le canton de Neuchâtel, au nord-ouest de la Suisse.

Les communes limitrophes sont: au nord,  Noiraigue , Brot-Dessous et Rochefort; à l'est, Colombier et Bôle; à l'ouest, Bevaix et Gorgier. Cortaillod et le lac de Neuchâtel  marquent la frontière sud.

Boudry est le chef-lieu du district du  même nom. La commune est adossée à la Montagne de Boudry, parcourue et longée par l'Areuse qui, se frayant un chemin à travers la chaîne du Jura, a creusé les Gorges de l'Areuse,  l'un des plus beaux canyons jurassiens.

Boudry cinquième cité du canton, s'étend sur près de 17 km2. Tout en protégeant ses forêts (1000 hectares), son vignoble (65 hectares) et ses champs cultivés, la ville n'a cessé au cours des ans, de se développer.

La Ville de Boudry est très bien desservie par la route nationale 5 reliant Neuchâtel à Lausanne, la ligne de chemin de fer du pied du Jura et les transports publics, principalement le littorail ( train régional qui effectue le trajet entre Neuchâtel et Boudry).

Un petit aérodrome est également accessible dans la Plaine d'Areuse.